Berkat bantuan beberapa orang ahli dalam pembuatan logo, setelah kami menyampaikan ide-ide yang ingin ditampilkan dalamlogo tersebut, dan dengan koreksi oleh para Kepala Sekolah dan beberapa guru, maka terbentuklah logo Yayasan Puspita Kencana. Logo ini mulai digunakan sejak tahun 2004.
Logo sekolah sudah ada sejak berdirinya sekolah, karena logo itu berlaku untuk semua karya pendidikan yang didirikan oleh konggregasi Misionaris Claris. Dari tahun ke tahun terjadilah perubahan bentuk maupun warna dasar dari logo tersebut.
Setelah kami mempelajari dari kata-kata yang ada dalam buku "Proyecto Educativo MC" dan berkonsultasi dengan beberapa orang ahli dalam pembuatan logo, maka diadakan revisi logo dan telah disetujui oleh para Kepala Sekolah
Berhubung ada alih generasi, maka dianggap perlu untuk mengeluarkan kebijakan mengenai penggunaan logo tersebut.
Semoga logo yang kita gunakan ini benar-benar berguna bagi penjiwaan karya pendidikan kita.
Sr. Bernadet Ngole, MC
Ketua Yayasan